En la isla de Voya Nui, los malvados Piraka han robado las seis máscaras elementales de los Toa. Depende de ti explorar los templos de la isla, recuperar las máscaras y derrotar a los Piraka y sus secuaces.
Bionicle Heroes DS es un juego de disparos en primera persona clásico. Como un Matoran sin nombre, viajarás a través de 25 niveles temáticos (que incluyen junglas, mundos de lava, antiguos templos subterráneos) y descubrirás nuevas armas y nuevos enemigos robóticos para destrozar. En el camino, utilizarás los poderes de las máscaras para sobrevivir en entornos hostiles, además de recolectar engranajes y piezas de robots para resolver acertijos sencillos ensamblando rampas, puentes y puertas estilo LEGO.
Los niveles del juego están poblados por una gran variedad visual de villanos inspirados en Bionicle, incluidos los que se transforman, vuelan, ruedan o cargan contra ti con aguijones parecidos a los de un escorpión. Afortunadamente, podrás mejorar tus armas y destruirlas con explosiones de plasma, rayos y láseres de francotirador.
El juego también contiene un sólido modo multijugador local que permite que hasta 4 jugadores compitan en combates a muerte en arenas repletas de mejoras de armas y máscaras.