Crysis 2 es la secuela de Crysis y el segundo juego principal de la saga, tras el título original y su expansión independiente Crysis: Warhead. Se trata de un juego de disparos en primera persona donde el armamento básico se mejora con un nanotraje que proporciona habilidades adicionales, como en el primer juego. Se han tomado prestados muchos elementos básicos de su predecesor, con el cambio de escenario como una diferencia notable; el juego se aleja del entorno selvático de una isla tropical, como también aparecía en Far Cry, el anterior juego de Crytek, para acercarse a un escenario de guerra urbana más oscuro, ambientado en el paisaje urbano destruido de una futura Nueva York en 2023, tres años después de los eventos del primer juego.
El jugador asume el papel de Alcatraz, un marine de reconocimiento de la fuerza y un protagonista diferente al del primer juego. La ciudad de Nueva York está devastada y parcialmente bajo la ley marcial tras un brote del virus Manhattan, que causa colapso celular. Al mismo tiempo, la ciudad se ve afectada por una infestación de la raza alienígena Ceph, presente también en el juego original. Alcatraz se despliega inicialmente como marine regular en C.E.L.L., una organización militar privada perteneciente a Crynet, que desarrolló el nanotraje. Durante una de las primeras misiones, Alcatraz se encuentra solo y conoce al mayor infectado Laurence Barnes, quien posee una versión 2.0 actualizada del traje. Se lo entrega a Alcatraz, quien, en consecuencia, debe enfrentarse a los Ceph y a los soldados de C.E.L.L., quienes asumen que es Barnes debido al traje. Crynet busca a Barnes porque representa un riesgo biológico activo debido a la infección y ha expresado sus críticas por los efectos secundarios que conlleva el uso del traje.
