La Guerra Fría, una situación creada después de la Segunda Guerra Mundial cuando el mundo estaba dividido entre Oriente y Occidente, está a punto de calentarse cuando los soviéticos recuperaron a su principal científico, Nikolai Stepanovich Sokolov, debido a un acuerdo con el gobierno de los EE. UU. Para retirar la energía nuclear. misiles de Cuba. Ahora, con Sokolov en sus manos, están listos para desarrollar una nueva y poderosa arma, y al darse cuenta de la urgencia de la situación, la CIA formó un plan para recuperar a Sokolov. Envían la unidad FOX encubierta a las instalaciones de investigación de Sokolov, ubicadas al sur de la gran fortaleza soviética de Groznyj Grad. Dirigido por el ex miembro de SAS Major Zero, FOX es una unidad de fuerzas especiales de próxima generación que opera como un grupo de combate especializado y como un equipo de inteligencia encubierto. El modus operandi de la unidad FOX es enviar un solo agente,
24 de agosto de 1964, un soldado solitario desciende de la nada. El nombre en clave del hombre es Serpiente Desnuda. Es una guerra de un solo hombre ahora, y el futuro del mundo ahora puede descansar completamente sobre sus hombros.
Metal Gear Solid 3: Snake Eater es la precuela de toda la serie Metal Gear . La mayoría de los elementos de juego que definen la serie se han transferido. Como antes, Snake debe usar el sigilo y el ingenio en lugar de la fuerza bruta para infiltrarse en las zonas enemigas y eliminar a sus principales adversarios. También se encuentran presentes situaciones de acción y batallas contra jefes que requieren que el jugador descubra los puntos débiles del enemigo y emplee tácticas únicas para derrotarlo.
Se han agregado varias características de juego notables. A diferencia de los juegos anteriores, gran parte de la acción de esta entrega tiene lugar en un gran entorno al aire libre, la jungla (geográficamente imprecisa). La serpiente puede usar el camuflaje: trepa a los árboles, se esconde en la hierba alta o usa ropa que lo haga menos notorio. La serpiente también puede cansarse y tener hambre; Es necesario recolectar raciones o incluso cazar animales salvajes para alimentarse. Puede sufrir lesiones (por ejemplo, romperse un brazo), que deben tratarse de una manera específica, a diferencia de la barra de salud única de los predecesores.