El Rey Rana ha muerto y Shrek ha heredado el trono. Como Shrek no es un gran admirador de esta idea, él y sus amigos viajan a la academia de Worcestershire para reclutar al primo de Fiona, Artie, para el trabajo. Desafortunadamente, mientras está fuera, el malvado Príncipe Azul tiene grandes planes para apoderarse del reino.
SHReK the THiRD es un juego de plataformas y acción con un gran énfasis en las peleas y el humor. Con muchos matones del Príncipe Encantador en su camino (incluidos caballeros negros, gnomos malvados, un Capitán Garfio que canturrea y árboles caminantes gigantes), Shrek tendrá que usar todas sus habilidades para derrotarlos, encontrar el camino a casa y recoger algunos tazas de recuerdo en el camino.
Cada nivel presenta varias misiones, muchos coleccionables y situaciones divertidas. Si bien la mayoría de los niveles cuentan con el propio Shrek, hay seis personajes jugables en total (burro, gato con botas, Fiona, Artie y la bella durmiente también), más de 20 niveles, tres batallas contra grandes jefes y varios minijuegos multijugador.